4位はヨハン・ザルコ、5位アレックス・リンス、6位ジャック・ミラー、ルーキのルカ・マリーニは7位、アプリリアのアレイシ・エスパルガロが8位、ミゲル・オリヴェイラが9位、マーべリック・ビニャーレスが10位となりこの10名がQ2進出を決めた。
なお、セッション最後にはPramacのホルヘ・マルティンが転倒してレッドフラッグとなった。なお、マルティンは転倒の際にグラベルで頭部、腕部などを激しく打っており、今週末のレースを欠場することになる。
ポルトガルGP FP3結果
| 順位 | ライダー名 | タイム | 最高速度 |
| 1位 | ファビオ・クアルタラロ | 1’39.044 | 332.3km/h |
| 2位 | フランコ・モルビデッリ | 1’39.095 | 335.4km/h |
| 3位 | フランセスコ・バグナイア | 1’39.117 | 343.9km/h |
| 4位 | ヨハン・ザルコ | 1’39.228 | 348.3km/h |
| 5位 | アレックス・リンス | 1’39.328 | 338.5km/h |
| 6位 | ジャック・ミラー | 1’39.345 | 346.1km/h |
| 7位 | ルカ・マリーニ | 1’39.600 | 339.6km/h |
| 8位 | アレイシ・エスパルガロ | 1’39.690 | 342.8km/h |
| 9位 | ミゲル・オリヴェイラ | 1’39.697 | 335.4km/h |
| 10位 | マーべリック・ビニャーレス | 1’39.742 | 331.2km/h |
| 11位 | アレックス・マルケス | 1’39.796 | 341.7km/h |
| 12位 | ジョアン・ミル | 1’39.818 | 335.4km/h |
| 13位 | ポル・エスパルガロ | 1’39.828 | 341.7km/h |
| 14位 | バレンティーノ・ロッシ | 1’39.912 | 336.4km/h |
| 15位 | マルク・マルケス | 1’39.945 | 338.5km/h |
| 16位 | ブラッド・ビンダー | 1’40.196 | 341.7km/h |
| 17位 | ダニーロ・ペトルッチ | 1’40.302 | 337.5km/h |
| 18位 | エネア・バスティアニーニ | 1’40.343 | 340.6km/h |
| 19位 | ホルヘ・マルティン | 1’41.046 | 345km/h |
| 20位 | ロレンソ・サヴァドーリ | 1’41.190 | 339.6km/h |
| 21位 | 中上 貴晶 | 1’41.566 | 333.3km/h |
| 22位 | イケル・レクオーナ | 1’41.568 | 336.4km/h |