マレーシアの予選でQ2に進出を決めたのはファビオ・ディ・ジャンアントニオ、エネア・バスティアニーニの2人だった。3位はアレイシ・エスパルガロ、4位アウグスト・フェルナンデス、5位フランコ・モルビデッリ、6位ジョアン・ミル、7位ポル・エスパルガロ、8位ラウル・フェルナンデス、9位ミゲル・オリヴェイラ、10位マルク・マルケスとなった。
マレーシアGP Q1結果
| 順位 | ゼッケン | ライダー名 | メーカー | タイム | 最高速度 |
| 1位 | 49 | ファビオ・ディ・ジャンアントニオ | DUCATI | 1’57.823 | 328.2km/h |
| 2位 | 23 | エネア・バスティアニーニ | DUCATI | 1’57.911 | 332.3km/h |
| 3位 | 41 | アレイシ・エスパルガロ | APRILIA | 1’58.069 | 333.3km/h |
| 4位 | 37 | アウグスト・フェルナンデス | KTM | 1’58.107 | 331.2km/h |
| 5位 | 21 | フランコ・モルビデッリ | YAMAHA | 1’58.321 | 331.2km/h |
| 6位 | 36 | ジョアン・ミル | HONDA | 1’58.440 | 334.3km/h |
| 7位 | 44 | ポル・エスパルガロ | GASGAS | 1’58.555 | 335.4km/h |
| 8位 | 25 | ラウル・フェルナンデス | APRILIA | 1’58.623 | 329.2km/h |
| 9位 | 88 | ミゲル・オリヴェイラ | APRILIA | 1’58.638 | 332.3km/h |
| 10位 | 93 | マルク・マルケス | HONDA | 1’58.717 | 335.4km/h |
| 11位 | 30 | 中上 貴晶 | HONDA | 1’58.886 | 329.2km/h |
| 12位 | 19 | アルヴァロ・バウティスタ | #N/A | 1’59.418 | 333.3km/h |
| 13位 | 27 | イケル・レクオナ | HONDA | 1’59.658 | 329.2km/h |