路面47℃となったマレーシアGPのQ2結果です。目まぐるしく順位が入れ替わる中で、ポールポジションを獲得したのは、バルセロナ以来初となるポールポジション獲得となったペドロサ選手。2位にはこの3連戦で全て1列目を獲得しているザルコ選手。3位にドヴィツィオーゾ選手となりました。
ロッシ選手は4位、5位ビニャーレス選手となり、ヤマハ勢トップをサテライトのザルコ選手に譲りました。6位には最後の最後にロレンソ選手が入り、これでマルケス選手を3列目7番グリッドに叩き落とす結果となりました。8位にはリンス選手、9位イアンノーネ選手、10位クラッチロー選手という結果となりました。