FP2でトップタイムを記録したのはファビオ・クアルタラロ、2位フランコ・モルビデッリ、3位ヨハン・ザルコとなった。4位ホルヘ・マルティン、5位エネア・バスティアニーニ、6位ジャック・ミラー、7位アレイシ・エスパルガロ、8位ブラッド・ビンダー、9位ミゲル・オリヴェイラ、10位アレックス・リンスとなった。
FP2は土曜日の天候が崩れると予想されていることから、タイムアタックの様相を呈し各ライダーがトップ10＝Q2進出をかけて激しいタイムアタックを実施した。今回はミシュランがハード寄りのタイヤを持ち込んでいることから、このタイヤをうまく機能させることが鍵となっているため、タイヤをうまく使いこなした選手が上位に来ている印象だ。
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インドネシアGP FP2結果
路面：ドライ
気温：31℃
湿度：70%
路面温度：48℃
| 順位 | ライダー名 | タイム | 最高速度(km/h) |
| 1位 | ファビオ・クアルタラロ | 1’31.608 | 307.6km/h |
| 2位 | フランコ・モルビデッリ | 1’31.638 | 304.2km/h |
| 3位 | ヨハン・ザルコ | 1’31.893 | 308.5km/h |
| 4位 | ホルヘ・マルティン | 1’31.904 | 308.5km/h |
| 5位 | エネア・バスティアニーニ | 1’31.921 | 311.2km/h |
| 6位 | ジャック・ミラー | 1’31.965 | 307.6km/h |
| 7位 | アレイシ・エスパルガロ | 1’32.008 | 309.4km/h |
| 8位 | ブラッド・ビンダー | 1’32.017 | 309.4km/h |
| 9位 | ミゲル・オリヴェイラ | 1’32.049 | 309.4km/h |
| 10位 | アレックス・リンス | 1’32.106 | 308.5km/h |
| 11位 | アンドレア・ドヴィツィオーゾ | 1’32.303 | 305.9km/h |
| 12位 | 中上 貴晶 | 1’32.314 | 306.8km/h |
| 13位 | マーべリック・ビニャーレス | 1’32.344 | 307.6km/h |
| 14位 | ファビオ・ディ・ジャンアントニオ | 1’32.418 | 303.3km/h |
| 15位 | マルコ・ベッツェッキ | 1’32.471 | 308.5km/h |
| 16位 | アレックス・マルケス | 1’32.554 | 307.6km/h |
| 17位 | ラウル・フェルナンデス | 1’32.557 | 305.9km/h |
| 18位 | レミー・ガードナー | 1’32.626 | 304.2km/h |
| 19位 | ポル・エスパルガロ | 1’32.628 | 309.4km/h |
| 20位 | ジョアン・ミル | 1’32.641 | 308.5km/h |
| 21位 | フランチェスコ・バニャイア | 1’32.845 | 306.8km/h |
| 22位 | マルク・マルケス | 1’32.847 | 308.5km/h |
| 23位 | ダリン・ビンダー | 1’33.014 | 306.8km/h |
| 24位 | ルカ・マリーニ | 1’33.223 | 305km/h |